盛松柏¹ , 田菊² , 庞晓明^1*

1北京林业大学生物科学与技术学院, 林木育种国家工程实验室, 林木花卉遗传育种教育部重点实验室, 北京, 100083; 2内蒙古和盛生态科技研究院有限公司, 呼和浩特, 011517
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《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2017年04月14日    接受日期: 2017年04月17日    发表日期: 2018年01月19日

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COBRA作为一类GPI锚定蛋白，主要作用于细胞伸长与纤维素沉积。本研究在‘冬枣’全基因组中成功地鉴定到10个冬枣COBRA相似基因(ZjCOBL)，并对该基因家族成员进行生物信息学分析，还研究了各成员在‘冬枣’7个不同组织中的表达模式。所有潜在的COBRA相似蛋白都具有CCVS保守结构域，其中8个相似蛋白具有N端信号肽序列，big-PI程序预测出7个蛋白为潜在的GPI锚定蛋白。根据基因结构和系统演化分析等依据，冬枣中的COBRA相似蛋白可以分为两个亚家族(SFs)，其中SF I亚家族氨基酸相似性为43.3%到79.9%，SF II亚家族为58.3%到67.9%。10个ZjCOBL基因分别位于枣树12条染色体中的5条染色体和一段scaffold上。Real-time RT-PCR试验表明，所有ZjCOBL基因在冬枣各个器官和不同生长时期均有表达。其中，ZjCOBL7与番茄上的SlCOBRA-like为直系同源基因，具有相似的表达模式，推测ZjCOBL7可能与枣果实的质地和成熟软化相关。

 

冬枣；COBRA基因家族；系统演化分析；基因表达